Per l'immunoterapia specifica sono disponibili allergeni nativi e allergoidi. Gli allergoidi sono allergeni nativi modificati chimicamente. Il concetto che sta alla base dei preparati contenenti allergoidi è quello di ridurre eventuali effetti collaterali senza incidere sull'efficacia, ma i pareri a tale riguardo sono comunque controversi. ALK utilizza allergeni nativi poiché ritiene che siano meglio indicati per un'immunoterapia che duri nel tempo. Finora è stato possibile dimostrare un effetto durevole soltanto per alcuni preparati destinati all'ITS basati prevalentemente su allergeni nativi.
